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      華為企業云加速精準醫療云落地

      摘要:自 “孟德爾摩根從豌豆的種植發現基因以后,二百年內世界上沒有任何人理解這個概念,兩百年后基因研究才慢慢發展起來”?;蚬こ淘诤荛L一段時間處于靜默期,進入21世紀后,隨著科研水平和IT技術的發展,基因工程有了突飛猛進的發展,讓人們利用基因組信息開展精準醫療并最終改善人類健康成為可能。
      作者: 廠商動態
      自 “孟德爾摩根從豌豆的種植發現基因以后,二百年內世界上沒有任何人理解這個概念,兩百年后基因研究才慢慢發展起來”?;蚬こ淘诤荛L一段時間處于靜默期,進入21世紀后,隨著科研水平和IT技術的發展,基因工程有了突飛猛進的發展,讓人們利用基因組信息開展精準醫療并最終改善人類健康成為可能。
      從單個基因解密到今天大規模人群基因組、臨床表征等數據的快速積累,基因組研究在近期實現了質的飛躍。業內專家認識到,要想真正實現基因組信息服務于人類,一方面必須有針對遺傳性疾病、腫瘤等針對性的診療的解決方法,另一方面必須解決海量基因組和臨床數據的存儲、分析和共享等方面的挑戰。這正是精準醫學產業的巨大發展機遇。
      從全球看,精準醫療正在得到越來越多國家的重視。國際上目前3個大洲的8個國家紛紛公布了國家精準醫學計劃,中國“十三五發展規劃”也把精準醫學作為戰略新興產業。伴隨著精準醫學研究項目在全球以及國內的全面推進,如何圍繞精準醫學更好地服務廣大老百姓成為醫療行業領導者思考的問題。如果能基于云計算技術打造一個充分整合醫藥研發經驗和的精準醫學處理技術的大數據云平臺,是不是就能更好地幫助醫療機構未患者提供方便快捷的精準醫療服務呢?藥明康德明碼生物科技公司審時度勢,富有前瞻性地認識到了這其中的市場機遇。
      華為企業云加速精準醫療云落地
      國內首個精準醫療大數據云平臺誕生
      在幾年前,冰島完成了全球迄今為止完成的規模最大的國家精準醫學研究,對全國總共35萬人口進行了全基因測序,這就產生了30多PB的數據,然而,冰島當時的deCODE公司使用的Oracle 數據庫的架構無法高效的處理這種海量的數據,于是deCODE公司的IT負責人,來自MIT的計算機系教授另辟蹊徑,自己創造了一種適用于基因組大數據處理的GOR數據庫。這套系統是目前全球唯一一個處理過30多萬人全基因組的數據,并在多項國際競標的項目中獲得了多個國家精準醫學項目的認可,包括英國10萬人基因組、卡塔爾的35萬人基因組計劃,以及美國西蒙基金會自閉癥的基因組計劃等等。
      GOR數據庫及在此基礎上開發的序列分析、臨床序列分析和腫瘤分析模塊構成了今天藥明康德明碼科技的精準醫療大數據分析平臺,并已在冰島、卡塔爾和英國的國家級精準醫學項目上得到廣泛認可和使用。我們完全有理由相信,這一得到國際認可的數據分析平臺同樣也能為中國的國家精準醫學項目做出突出的貢獻。
      今年五月,藥明康德聯合華為企業云發布了中國首個精準醫學大數據云平臺---明碼云。明碼云旨在打造覆蓋全國、標準統一、安全可靠的精準醫學云服務,推動國內基因組信息及精準醫學大數據的集中和應用,促進政府相關部門、醫療行業、學術界以及業界在精準醫學領域的交流與合作,全面助力中國的精準醫學計劃。
      明碼云所獨有的GOR技術世界領先,在全基因組數據查詢速度上比基于Hadoop的大數據整合平臺高出10倍。明碼云中的WuXiNextCODE cloud系統是專門為精準醫學大數據而開發的,其通過獨有的彈性計算與數據存儲設備實現快速數據導入和導出。專為基因組設計的GOR數據庫結合臨床序列分析序列挖掘模塊為精準醫學大數據的全面分析提供了更加高效的工具。此外,為了保證數據的隱私和安全,明碼云在軟件系統使用了美國DNANexus的安全系統,后者已經被美國的國家精準醫學計劃所采用。
      華為企業云為精準醫學大數據處理提供強有力的支撐
      精準醫學云平臺需要一個可以通過普通互聯網獲取專業的計算資源的快捷通道;一個按需配置,計量收費,用完釋放的高效系統;可定制化、彈性可擴展的存儲系統以及界面友好,操作簡單的管理界面。
      華為企業云是一家專注打造企業級云基礎設施服務的供應商,藥明康德的明碼云選擇與華為企業云合作,第一保證了IT架構安全,穩定,可信賴,華為企業云所有的機房都是采用T3+標準進行建設,相較于傳統信息化,云服務提供專業的安全保障體系,通過分布式存儲和異地災備為客戶的數據和業務保駕護航;第二是可以獲得專業的IT構架維護,華為專業的人員維護為客戶免去維護的后顧之憂,讓專業的人做專業的事,客戶更聚焦自身的核心業務。第三. 使用效率高,傳統信息化建設需要招標、采購、選型等繁瑣的流程,需要大量的時間,上線一套系統往往需要3-5個月的時間,但是云服務資源是隨時使用的,通過在網站上的簡單操作即可10分鐘快速開通所需資源;第四、輕松擴展,企業的一些應用會面臨著業務浪涌和快速擴展,而云服務擁有海量資源池,可以支持企業業務彈性擴展;第五,資源共享,基于云計算的統一建設,實現資源最大程度的共享,同時有利于數據集中進行大數據分析;第六,覆蓋全國的網絡IT資源,華為企業云目前已經在全國布局20余個數據中心;
      華為公司領先的云計算技術水平和運營能力,結合藥明康德世界一流的醫藥研發能力,以及明碼生物科技在分析、挖掘、共享基因組學及精準醫學大數據方面端到端的豐富技術經驗,將為中國精準醫學大數據建立一個可信賴本地化的云計算、云存儲、云分享和交換的全國云服務網絡平臺。
      借力云計算,加快推動精準醫療產業發展
      “明碼云”平臺所采用的相關技術此前已經被同步應用于世界四大洲的智慧城市建設,以及全球多個國家和地區的精準醫學項目:從基因發現到國家基因組計劃,從臨床診斷到智慧醫院,從靶向藥物研發到個性化健康管理,一個統一的云平臺可以實時支持基因組學的臨床及科學研究,通過“全國聯網”在國家層面高效推動精準醫學研究項目的開展。
      目前,精準醫療領域的發展在全球尚處于起步期。不過,已經有部分醫療機構和已經在用基因檢測作為遺傳性疾病的診斷手段。例如,在罕見病診斷領域全球領先的波士頓兒童醫院就在用明碼云平臺的數據分析系統進行遺傳病的診斷;國內兒科領域的領軍者復旦大學附屬兒科醫院也在使用該系統做遺傳病的診斷,并成立了罕見病中心。除此之外,其他的一些機構正在使用這一系統進行基因檢測,以作為抗腫瘤精準用藥的指導。
      另一方面,美國的西蒙基金會也是明碼云的用戶,前者擁有目前全球最大自閉癥基因數據庫,包含來自閉癥患兒家庭的10,000個外顯子組數據。如今,他們可以通過明碼生物科技的臨床發現分析工具進行云端查詢,凝聚基因組和互聯網,實現實時查詢與合作。作為數據標準以及空前規模的自閉癥基因組學研究的樞紐,這一數據庫能夠與世界上的其他主要數據庫無縫對接??梢哉f,以云計算平臺為依托的基因組醫療大數據的時代已經來臨。
      小結:
      精準醫療是一種將個人基因、環境與生活習慣差異考慮在內的新型醫學概念與醫療模式,是下一代醫學的發展方向,云計算是未來的發展趨勢,將為企業創新、信息成本降低、工作方式及商業模式等帶來根本性改變。
      明碼云就是藥明康德依托華為企業云進軍精準醫學產業的一個重要平臺。依托華為企業云,實現在云端有效完成數據存儲,分析和管理,將最后結果交付給專業的人做專業的事。藥明康德與華為企業云的深度合作還體現在人口和疾病隊列的精準醫學項目上,通過整合臨床研究檢測數據與基因組數據,將其進行存儲、次級處理以及個性化的高級分析,從而來發現藥物靶點以及生物標志物。
      相信雙方的合作可以幫助行業和科研工作者更加充分地利用基因組學和大數據的力量,推動中國精準醫學研究以及個性化健康管理,最終實現以基因為出發點來規劃個人的飲食生活習慣,達到精準健康的目的。
      【所屬欄目:技術前沿】    【查看次數:7419次】    【發布時間:2016年7月29日】  
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